Характер почв, их разнообразие зависят, прежде всего, от местных материнских пород и характера растительного покрова. Песчаные субстраты Северогерманской низменности сильно выщелочены, эти кислые подзолистые почвы не благоприятны для выращивания сельскохозяйственных культур. Имеются крупные ареалы кислых болотных почв. Почвы гор Средней Германии весьма разнообразны. Прочные коренные породы горных массивов длительное время подвергались выветриванию в условиях прохладного влажного климата, и там сформировались выщелоченные кислые бурые лесные почвы, которые иногда содержат много камней. Они используются под пастбища или леса. На низменностях и речных террасах распространены самые плодородные почвы - черноземы, встречающиеся к востоку от Гарца и в Тюрингенском бассейне переходящие в бурые лесные почвы. Здесь расположены лучшие пахотные земли.

Наиболее благоприятными условиями выделяется район Брауншвейга – Ганновера с чернозёмовидными почвами. Рейнская и Мозельская долины представляют собой полосу виноградников, садов, табачных плантаций, зону интенсивного пригородного хозяйства, снабжающую города по Рейну. Почвы группы буроземов распространены на равнинах восточного Шлезвиг-Гольштейна и предгорных равнинах Баварии. Почвы Альп различаются в зависимости от высотного положения местности и крутизны склонов. Это маломощные каменистые почвы, выщелоченность которых возрастает с высотой. У прибрежной полосы Северного моря находится илистая плодородная почва. Затем местность переходит в песчаные или заболоченные пространства. Богатые почвы в сочетании с мягким морским климатом со среднегодовой температурой +8˚С создают прекрасные условия для луговодства и животноводства. Плодородие почв существенно повышено мелиорацией и регулярным внесением удобрений.

Естественный растительный покров практически не сохранился. Несмотря на то, что свыше 30 % территории страны покрыто лесами, все они представляют собой либо искусственные посадки, либо древостой, возникшие на месте вырубок. Основная их часть сосредоточена в Среднегерманских горах. Преобладают хвойные леса из ели и сосны, в горах – хвойно-широколиственные с участием бука, дуба, граба и др.; по долинам рек – пойменные леса из ивы, тополя.

Меньше всего лесов на северо-западе и юге равнинной части страны, выше средней лесистость в горных областях, а также в округе Франкфурт, на юге округа Нёйбранденбург и на севере округа Потсдам. Густые леса покрывают округ Котбус. Лиственные и сосновые леса сохранились в районе зандровых низменностей, в частности в окрестностях Берлина. Для Магдебургского поозерья характерны небольшие, но многочисленные массивы буковых лесов с примесью березы, сосны – на песчаных почвах и ольхи – в поймах рек. На возвышенности Флеминг преобладают вереск, можжевеловые и травянистые пустоши.

Много деревьев хвойных пород: на севере преобладает сосна, в центре и на юге – ель. В самых высоких массивах, а также в Альпах выше 2200–2800 м растут травы, лишайники и мхи. Очень большое обилие цветковых растений.  Среди цветов особенно популярна фиалка трехцветная. Это символ оживающей природы. Растет на лесных опушках, на лугах, среди кустарников. В честь первого весеннего цветка в Германии отмечается День весны. В долине Дуная встречается степная растительность, на юго-западе – средиземноморская, на северных равнинах и Баварском плато – торфяные болота.